La PDI es una institución dependiente del Ministerio encargado de la Seguridad Pública, actualmente el Ministerio de Defensa Nacional, integrante de las Fuerzas de Orden y Seguridad Pública, que por mandato constitucional existe para dar eficacia al derecho,  garantizar el orden público y la seguridad pública interior, tiene un carácter profesional, técnico y científico y su personal está sometido a un régimen jerárquico y disciplinario estricto.

El Mando y la Jefatura Superior, la Dirección y Administración de la Policía de Investigaciones de Chile, corresponden al Director General, quien para la consecución de estos objetivos tiene las máximas potestades administrativas y reglamentarias internas.

La institución se relaciona con las Secretarías de Estado por intermedio de la Dirección General. Las Intendencias, Gobernaciones, Alcaldías y otros organismos regionales, provinciales o locales, se relacionan a través de las Jefaturas Regionales, Prefecturas, Brigadas y otras reparticiones, según proceda.